Структура

Руководство института

Лаборатория биомониторинга

Лаборатория гидрологии

Лаборатория гидробиологии

Лаборатория биогеохимии

Лаборатория эколого-аналитических измерений и мониторинга окружающей среды

Лаборатория экологических биотехнологий

Лаборатория экспериментальной экологии

Лаборатория экологии почв

Лаборатория прикладной экологии

Лаборатория геологического и экологического моделирования

Лаборатория правовых проблем недропользования, экологии и топливно-энергетического комплекса

Отдел кадров, канцелярия.

Планово-экономический отдел

Отдел хозяйственной деятельности